漢唐年間，氣功在醫務界頗為盛行。當時的名醫如華佗、葛洪、陶弘景、巢元方、孫思邈等都是精於氣功的大師。他們在氣功健身的實踐和文獻的整理上都有重大的貢獻。

　　宋、遼、金、元四朝，戰爭頻繁，社會動盪，百病叢生，急需解決疾病的治療是當時醫學界面臨的最迫切問題。所以，氣功雖已不像漢唐時期那麼盛行，但並沒有被排斥在醫界正宗之外。金元時期醫學界四大名醫之一、寒涼派代表人劉完素在他的《素問病機氣宜保命集》中就有氣功養生的記載：「吹噓呼吸，吐故吶新……此皆修真之要也」。金元四大家之一的李東垣也認為：「夜半收心靜坐少時，此生發週身血氣之大要也」。他還主張「安於淡泊，少思寡顧。省語以養氣，不妄作勞以養形，虛心以維神」。另外，攻下派的張子和也將導引吐吶列為治病方法之一。

　　明至清末，氣功在醫學界更受重視，氣功養生的著述也較多。明代名醫張景岳在《類經》一書裡，對氣功有正確的評價，並且涉及了氣功和藥物的長短所在。他說：「……雖軒歧之教，初未嘗廢恬淡虛無，呼吸精氣之說，然而緩急之宜，各有所用，若於無事之時，因其固有而存之養之，亦是為卻病延年之助，此修養之道，而能及其妙者，固不可不知也。至於疾病既成，營衛既亂，欲捨醫藥，而望其可除，無可復，則無是理也」。對氣功的具體做法，張氏認為「其下乎功夫惟《蔣氏調氣篇》、《蘇氏養生訣》、《李真人長生十六訣》皆得其法，足為入門之階。」

　　宋代的《聖濟總錄》載有「以意氣攻病法」，曰：「其有宿患，但用意並氣，法之患處，不過三五日，必愈。若四肢有患，亦可想氣以攻之，其病隨散。」這種療法，清代醫家稱為「運氣法」。清代名醫張志聰對「運氣法」深有體驗，他曾用此法攻除自身的癰毒。

　　此外，明清醫家如李士材、龔廷賢、龔居中、李時珍、沈金螯等對氣功療法均有論述，不勝枚舉。